La gobernanza de la CONAIE se basa en el principio de “Gobernar Obedeciendo”, enfocándose en implementar las resoluciones del Congreso y las demandas históricas de nuestros pueblos. Buscamos fortalecer el Estado plurinacional desde una visión comunitaria, integrando nuevas formas de organización en los sectores urbanos debido a la migración indígena.

Nuestro objetivo es contribuir a la construcción del Estado plurinacional, promoviendo la gobernanza territorializada y el fortalecimiento del poder colectivo, con especial atención a la mujer, juventud y niñez, e integrando los territorios urbanos como parte del comunitario. Luchamos contra el extractivismo, apoyamos el desarrollo económico territorializado y trabajamos por políticas públicas inclusivas para todos los pueblos del Ecuador.

Defendemos las cinco soberanías comunitarias: política-organizativa, epistémica, territorial, económica-alimentaria y espiritual, protegiendo nuestros territorios y la Madre Tierra frente al cambio climático, la biodiversidad y los derechos humanos.